幾霜::残日録::2006/09/15 (金)

 

移籍先を探しています。系統樹推定法やメタバーコーディング法などに詳しい研究者を探している方がおられましたらご一報下さい。

2006/09/15 (金)

[Topics] 竹中平蔵参院議員辞職へ - 22:14:46

 無責任と言われてはいますが役割を果たせる見込みが無ければ当然の選択でしょう。私はこれで良いと思います。理想なのは安倍が再度経済閣僚に任命することでしたがあり得なさそうでしたし、恨みを背負って表舞台を去るのが最後の役割なんでしょう。

[Topics] 麻原死刑 - 22:11:22

 多分次期法務相が執行署名するんでしょう。一つの区切りにはなるんでしょうか。

[Topics] ローマ法王がムハンマド批判 - 22:08:57

 禁句に触れたバカ法王。この発言でどれだけの人が傷付くのか考えなかったのか。

[Hardware] RICOH Caplio R5 試写 - 21:31:54

 ヨドバシ仙台店で撮影してきました。ISO感度別にしてあります。被写体はGR DIGITALです。ISO64ではブレているようです(汗)。カメラ本体を展示台に押しつけて撮影したんですけどね・・・。とりあえずISO200とISO400の差が結構大きいですね。ただ、ISO400とISO800の間が個人的には耐えられる境界でしょうか。できるだけISO100〜200くらいで使いたいところです。そう考えるとAUTO設定が結構希望に近い感度に設定してくれている感がありました。

[Software] GPLとPAUP* - 18:19:41

 Perlで作成したGPLなスクリプトからsystem()関数でPAUP*を呼び出すことにGPL、およびPAUP*の利用許諾契約的に問題は無いのかが今更気になって調べてみた。と言うのも、Modeltestはともかく、MrAIC.plと同じ作者が制作しているMrModeltestもPAUP*を内部的に呼び出す仕様になっていなかったので実はライセンス的に問題があったりするからなんじゃないだろうなと思ったからで。しかしp4とかってGPLですが内部でPAUP*呼び出していたような・・・あーよーわからん。
 で、まぁ調べた結果ですが、GPL的には「リンクされる」とかは問題みたいですが、「コマンドを呼び出す」場合は特に問題無さそうな感じなんですが合ってますかね。PAUP*の許諾契約にも特に問題になりそうな文言は見当たらない。

[Science] Bootstrapping model selection - 17:46:46

 なんとなく、リサンプリングデータでモデル最適化をやるのではなく、元データで最適化したモデルをリサンプリングデータに当てはめて得られた尤度を使用するのが目的に最も合っている気がしてきた。この方法ならRELLも使えて多少は高速化できるんではなかろうか。・・・そうして完成は遠のいていく。おいおい。
(注: 樹形はリサンプリングデータからNJで生成することでばらつかせる)

[Science] PAUP*でindelの情報を使う - 17:30:06

 こういう方法もあったのか。PSet GapMode=NewStateしか知らんかった。しかしこれ、最尤法は使えるのか? 無理っぽい気はするが、MrBayesは分子データと形態形質をごちゃ混ぜにできるからきっと扱えるんではないかな。それが良い方法かどうかは甚だ疑わしいが。っつーかあのごちゃ混ぜ可能な仕様は諸悪の根源だと思う。形態形質と分子データ間のデータの重みはどうやって決めるんよと。
 やっぱりindelを情報として使いたければ、indelに基づいた樹形制約ありでの樹形探索と、無しでの樹形探索を行った上で、結果が異なるなら何らかの根拠に基づいて樹形制約ありでの結果を採択するようにするしかないのではなかろうか。いや別に樹形制約無しの結果を採用してもいいけど。

[Science] PAUP*のLSet Rates=SiteSpecで塩基置換速度比を直接指定する方法 - 16:48:58

CharSet 1stpos=1-.\3;
CharSet 2ndpos=2-.\3;
CharSet 3rdpos=3-.\3;
RateSet codonrates=2.0:1stpos,1.0:2ndpos,3.0:3rdpos;
LSet Rates=SiteSpec SiteRates=RateSet:codonrates;

とか書けばいいらしい。っつーか見逃しとったよ・・・。

[Software] Rcmdrが更新 [RjpWiki] - 16:26:00

 データインポート機能の強化と扱える分布の増加が図られたようです。詳しくはRjpWiki/Rcmdrの機能をどうぞ。

[Hardware] IXY DIGITAL 900IS [ITmedia] - 14:17:43

 広角端が28mmに。これでコンバージョンレンズ対応ならなぁ。

追記 - 15:46:33
 LUMIX FX系もそうですが、望遠端が暗すぎ。F5.6(f=102mm)とかF5.8(f=105mm)ってなんやねん。しかしCaplio R5は望遠端f=200mmでF4.8だが広角端f=28mmがF3.3・・・。うーむ。

[Life] 大学構内完全禁煙にして欲しい - 12:42:37

 構内のベンチというベンチがヤニーズに占拠されて非常にウザイ。灰皿なんて要らない。禁煙にすればよい。

[Topics] 利用者が増えれば増えるほど価値が上がる - 08:22:15

 本気で言ってるんでしょうか。mixi利用者のほとんどが「利用者が増えれば増えるほど価値が下がってきている」と感じているような気がしてならないんですが。個人的にはmixiの時価総額はライブドア最盛期なんて話にもならないほどの過大評価だと思います。もしこれから株を買おうという方がいらっしゃいましたら、長期保有はせずに早々に売り抜けることを私は勧めますね。
 mixiの最大の問題は「(紹介がないと入れないから)安全・安心」というのは幻想にすぎないと言うことでしょう。かと言って他のSNSに価値があるとも思いませんが。mixiに改善点があるとしたら、情報の検索性と安定性の向上でしょうか。あとは幻想を可能な限り維持していくだけでそれなりにはなれるんじゃないでしょうか。コミュニティの力、いわゆるクチコミ宣伝力を生かして収益を上げる考えのようですがあんまり露骨に情報操作気味のことをやるといずれ信頼を失うでしょう。経営陣のその辺のバランス感覚が今後は重要になっていく気がします。

[Life] 寒い - 03:50:11

 ここ数日の仙台はちょう寒い。

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