幾霜::残日録::2007/06/19 (火)

 

移籍先を探しています。系統樹推定法やメタバーコーディング法などに詳しい研究者を探している方がおられましたらご一報下さい。

2007/06/19 (火)

[Software] Intel C++ Compiler 10でAMD製プロセッサにも使える最適化オプション追加 - 21:06:11

 リンク先のリリースノートの追加オプション一覧の最後から二番目「-xO」の項に

生成されるコードは、SSE3、SSE2、および SSE 命令セットに対応したインテル以外から提供されているプロセッサーでも動作することがあります。

とある。これまでICCでは普通に使っているとSSE最適化はAthlon 64 / Opteronでは使えませんでしたが、このオプションを使うといけそうです。

[Science] MrBayesではSeparate modelを適用するとTBRされない - 18:24:56

 さっきSeparate modelを適用しようとしてextending TBRが適用されないことに気付いた。表示が間違っているだけかもしれないが、事実だとするとSeparate model使えねーと言わざるをえんな。

[Science] 収束は遠い - 17:54:18

ASDSF

 現在約360万世代経過。ものすごーく少しずつ収束へ向かっているようには見えるんですが、180万世代目以降を直線回帰して0.01になるところを推定すると、12,037,500世代目。うーむ、続けるべきだろうか。Temp=0.2でNChains=4なんで、NChains=5にしたら多少改善しませんかねぇ。

[Life] 九大比較社会文化研究院でも助教の公募 - 17:03:40

 しかもこれも昆虫分子系統ですよ。これも来年やったらなぁ・・・。まぁ通らんでしょうけど。

[Software] OpenOffice.orgは画像をEPS形式へエクスポートできる - 16:49:31

ので、そんな面倒なことをやる必要はないはずですよ。

[Life] シーケンス開始 - 15:45:29

 310は泳動が始まってもいない段階からレーザーフルパワー全開なのがバカっぽい。

[Life] 九大博物館で動物学・昆虫学分野の助教公募 - 15:28:01

 だそうです。学位は持っている方が望ましいようですが必須ではないようです。来年だったら応募するんですけどねぇ・・・。

[Life] 乾燥終了 - 13:14:12

 エタ沈終わりました。Hi-Diホルムアミドを加えてインキュベートし、ペレット(見えませんが)を溶かしているところ。あとはヒートショックかけてチューブを移してシーケンサにセットするだけ。

[Life] シーケンス反応やりなおし - 07:52:54

 とりあえずエタ沈のミスの可能性が高いので、シーケンス反応をやり直し中。

[Life] 返事来た - 07:52:10

 えげれすのYさんからお返事。「適切な表示さえしてくれれば構わんが、改造に伴う問題はそっちでフォローしろよ」みたいな感じだった。まぁとにかくこれで配布の問題はクリアされたはず。PHYLIPはドキュメント読む限り問題無さそうなので訊いてないが、テスト公開を始めてからでも訊いてみるか。

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